Le Dr Alain Schoepfer effectue ses études de médecine à Bale où il obtient son diplôme et son doctorat en 1998. Il acquiert une formation
en médecine interne aux Hôpitaux de Altdorf et de Lucerne et se spécialise en gastro-entérologie et hépatologie à Lucerne et à l’Hôpital
Universitaire de Berne où il est nommé chef de clinique en 2006.

De janvier 2009 à juillet 2010 il séjourne au Farncombe Family Institute of Digestive Health Research à l’Université de McMaster en Canada
en qualité de postdoctoral research fellow en immunologie mucosale. Dès son retour en Europe il suit une formation clinique en endoscopie
avancée à l’Université de Friedrich Schiller à Jena (Allemagne). Il rejoint le Service de Gastro-entérologie et d’Hépatologie du CHUV en qualité
de médecin associé en décembre 2010.

Ses activités de recherche se concentrent sur les maladies inflammatoires intestinales. Il s’intéresse particulièrement à la valeur des marqueurs
biologiques dans la prédiction de l’activité endoscopique et le dépistage précoce des poussées inflammatoires. Dès 2005 il participe à la
« Swiss IBD Cohort Study » en contribuant à plusieurs publications. En outre, il est engagé dans une recherche sur l’œsophagite à éosinophiles
en collaboration avec la « Swiss Eosinophilic Esophagitis Research Group » et développe dès 2008, en collaboration avec un groupe d'experts
internationaux, un index d’activité pour l’œsophagite à éosinophiles. Ses travaux de recherche ont été récompensés par des prix nationaux et internationaux.